南疆技术转移中心于2017年由兵团第一师、塔里木大学和浙江大学联合筹建，经过三年的努力，目前已成为新疆唯一一家国家级技术转移人才培养基地，并与全国多所高校及国家级技术转移示范机构建立合作关系，中心现有技术转移专家300余人，拥有各类专利和其他知识产权2000余项。

该中心是塔里木大学实施“依托全国、服务南疆”发展，发挥科技创新发展在社会稳定、长治久安重要作用的职能部门，是一个组织与整合学校技术资源，面向南疆发展需求，实施产业化运作的机构；是集产权管理、技术转移、技术服务、技术咨询、跨地域技术合作、企业孵化、项目开发为一体的经营实体，通过科研设施和仪器设备开放共享平台建设、政产学研创新平台建设、创业企业孵化平台建设、科技咨询服务平台建设、跨地域技术转移平台建设五大核心业务，增强造血能力、提高科技转化能力、提升服务能力、拓展辐射能力、构建集聚能力，加强对南疆社会稳定和产业发展的技术引领、技术服务和技术集聚。